清光绪七年三月初十日（1881年4月8日）戊刻，慈安皇太后死于钟粹宫。对于这位作了慈禧太后陪衬而无所作为的东太后，她的死引起当时人的很多猜疑。七月初三日，慈安身体欠佳，而一个星期后即去逝，对于皇后来说，死得实在太快了点。所以《述庵秘录》说:“孝贞（慈安死后谥“孝贞”）崩，诸臣皆大惊，抵宫见孝贞已小殓，慈禧坐矮凳上。囊时，后妃薨，即传戚属入内瞻视后小殓，孝贞薨，椒房无预其事者。”

清宫规矩，后、妃死后，要即刻传令娘家人进宫作最后的告别后，才能小殓。可是慈安皇后死后，还没有等到她的娘家人到，就在慈禧的指挥下入了殓，大臣们不能不起疑心。据说慈安生前喜欢吃糕点等小食，就在慈安死前数小时，慈禧曾进献糕饼。是否真是慈禧的恶毒，并无更确切的史料证明。

吃惊的大臣们赶到钟粹宫哭丧。到了钟粹宫，经请示可以入殿哭丧。于是在钟粹宫的走廊上从东向西“列队长号，除冠碰头，伏哭尽哀”。皇太后的梓宫停在西头，太监将太后面幕撩起，让大臣们瞻仰遗容。据说慈禧太后为慈安服丧，以白绢蒙头，簪用白金，服的是重丧。成都公墓，成都公墓大概什么价格，成都公墓价格表，成都公墓公司排名。

遗体入殓后即将梓宫移到慈宁宫安放。死后十天（三月二十日），又转移到景山观德殿停灵。五月十三日，行尊谥礼，谥为孝贞慈安裕庆和敬仪天祚圣显皇后”，安葬地为“普祥峪定东陵”。六月十九日为百日祭奠，十五日为中元节祭奠。直到九月初七日行祖奠礼，初九日举行奉安大典。二十二日，神牌回京，升附神祠。

慈安太后的出殡还是比较风光的，据《闻尘偶记》记载孝贞太后出殡之日，余入东华门观礼。前导无甚排场，銮舆卫伞扇之外，只见捧香炉者，或十人或二十人为一队，分队前行。中夹以衣架、脸盆架，错杂其中。其余金银锞、纸札等等陆续而至，与寻常民间出大殡者无异，但品制不同耳。须臾，见梓宫自景运门出而上杠，与寻常棺椁亦无大异，惟和头作文点式，远望似黄色绣罩。正在趋前审视间，忽闻有一人喝站住！一朝谛视之，则恭邸（奕诉）也。而德宗即随之而至，头戴白草笠，穿白袍，青布靴。其时随从及观礼者几千百人，一切缟衣，上下无能区别。惟闻皇上缟素，靴用青布，王公亲友稍杀之，余皆不能用布，所以示别也。梓宫出城暂安殡宫，名日暂安殿，派王公轮班上祭，定期下葬，则设之永远奉安。”

慈安皇太后梓宫安放在慈宁宫，其殿中设置，除素色帏幔之外，棺前正中供奉神位，神位前放一张供桌，插香烛之类；再前面一桌为供果桌，一日三奠就供奉放在这一桌。早上有数十碟，中午用饽饽、鲜果等；供果桌前面为奶茶桌，奶茶桌前为放奠池的矮桌，矮桌旁有两个墩子，上面放奠酒用具如酒壶、酒爵之类。每次祭奠，在皇帝来之前，各大臣都要各就各位举哀。皇上就位后，侍臣供奉奶茶，由御前大臣代献。皇上一举手，御前大臣即起身将奶茶放在供桌上，皇上随即一叩头，各大臣也跟着叩头。如此三奠三叩，才算完毕。吃饭前，内官捧奶茶浇在地上，然后由执爵的捧酒出殿，浇在丹陛正中。如此者一日三奠。